无创胎儿亲子鉴定上单多肽链多态性技术性的功效，SNP（singlenucleotidepolymorphism,单多肽链多态性），关键就是指在基因组水准上由单独多肽链的基因变异所造成的DNA序列多态性。它是人们可基因遗传的基因变异中最普遍的一种。占全部己知多态性的90%之上。SNP在人类基因组中普遍存有，均值每500~1000个碱基对中就会有一个，估算其数量达到三百万个乃至大量。SNP所主要表现的多态性只涉及单独碱基的基因变异，这类基因变异可由单独碱基的变换（transition）或颠换（transversion）所造成，也可由碱基的插进或缺少引发。但一般 常说的SNP并不包括后二种状况。SNP做为亲子鉴定的填补基因遗传标识。

积累非父清除率和积累父权制指数值按GA/T965-2011或SF/ZJD0105001-2010中的规定测算。针对不符遗传规律的SNP,PI赋值能为0.00001. 当SNP与STR另外应用时，或好几个SNP另外应用时，需有直接证据说明SNP与STR是独立同分布的，或SNP中间是独立同分布的。不可以证实独立同分布时按单倍体型测算。当STR系统软件临床诊断結果不能明确一些繁杂亲缘关系时，SNP能够做为填补亲子鉴定的基因遗传标识。常染色体SNP合乎孟德尔遗传规律，即后代的等位基因一个来自于爸爸，一个来自于妈妈。在有异议的爸爸妈妈和小孩三份样版所检验的好几个SNP临床诊断結果，小孩的一对等位基因各自还有异议爸爸妈妈的基因型中寻找来源于时，不清除该有异议爸爸妈妈为小孩的生态学爸爸妈妈。Y染色体、X性染色体和线粒体SNP可在一些独特的亲缘关系评定中做为补充鉴定的基因遗传标识应用。